躯体形式障碍的发病原因有很多种可能，但是目前还未确认是什么 原因直接导致的，但以下因素的可能性是非常大的。
一、性特征，女性躯体形式障碍病人具有共同的病因，并且和反社会型人格障碍之间存在关联，而对男性病人而言，躯体形式障碍更多的和焦虑障碍存在关联。
二、神经生理，躯体形式障碍病人的双侧额叶存在对称性的功能障碍，非有事半球全部的功能障碍比后部不严重，躯体形式障碍病人优势大脑半球的功能障碍比健康对照和抑郁症病人严重。
三、心理社会因素，那么躯体形式障碍与精神创伤和慢性压力有关，创伤特别是儿童期的创伤，导致心理和身体分离，从而产生躯体化症状，严重受虐待儿童一以及青少年人群比其他人群更容易发生躯体形式障碍，而且可以引发自主神经活动增强。
